繁盛的中环街道上，突然一声巨响，美国银行押款车一亿美元新钞被天养生(吴京饰)一帮浪人于路上用炸弹行劫，爆炸引发巨大气流，多名无辜途人死伤，其中一人为警员陈晋(谢霆锋饰)的未婚妻子，陈晋从此立誓追捕天养生而报仇雪恨，可是天养生与一亿美元早已销声匿迹。
半年后，深宵的公路上，由见习督察方奕威(余文乐饰)带领的警员截查神秘车辆时遇上猛烈袭击，队员全体重伤，车上载着以天养生为首的浪人集团，集团成员高手如云，还有潜伏于浪人身边两年的警方卧底卫景达。证实天养生再现，警方高层如临大敌。高级警司章文耀(林嘉华饰)和罗沛权(郑浩南饰)共同策划连锁行动，誓要将通缉犯天养生逮捕。
其中根据卧底数据显示，卫景达有一名亲弟是巡警卫景灏(房祖名饰)，灏被重案组问话，碍于身份尴尬，灏亦被暂时停职，他深信哥哥忠诚，决定用自己的办法查探出哥哥的下落。陈晋带着军火案的犯人Tiger (伍允龙饰)到现场搜集证据，天养生和浪人突然出现把Tiger捉走，愤怒的晋一直等待养生再出现，那会就此罢休，可是以晋一人之力怎会是浪人对手，晋更因而从三楼高处坠下受伤…
陈晋、方奕威、卫景灏三人的目标同样是天养生等浪人，三子决定携手追查浪人下落，三人查出浪人回港目的是报仇及取回当日解款车的赃款，因为赃款早已被幕后黑手所吞拼，而下一个目标是唯一的生还者，护卫公司主管何永强(李灿琛饰)，迫使何透露出幕后主谋的身份。
灏亦在浪人天养义(安志杰饰)口中证实哥哥卫景达的死讯，灏悲愤难当，养义把灏锁在校巴上，并安置计时炸药。灏和一众小朋友的性命危在旦夕…养生迫晋和威到嘉年华和黑警夜交易，威的情报料女友梁凯琳(江若琳饰)查出解款车劫案的线索，茅头直指警方里的高层……
影片《男儿本色》是近期港产动作片中最为倾注人力、物力之电影。制片组花了三个月的筹备时间里不断开发，磡察新的拍摄场景，以满足剧本内连场的超级动作设计。其中最令人头痛的是序场的抢劫亿元运钞车的戏份，导演陈木胜为求真实，及带给观众前所未有的观影刺激。
他坚持要在香港商业心脏地带的中环实地进行拍摄各种大型爆破镜头。这是前所未有的拍摄。
秉着香港电影人打不死的专业精神，策划带领着制片组与特区政府的多个部门开展了漫长的交涉。为了给各官员对制作人员的技术及安全措施的信心，制作组安排多次的模拟拍摄及爆破示范场面等予有关部门参观。而在制作人的努力及真诚下，本片终获得香港开埠以来破天荒的拍摄准许证，在光天化日下，封锁了中环的三条主要道路，进行了这场令人叹为观止的爆破动作场面，当观众在银幕上欣赏到这犹如烟花灿烂的夜光效果时，请不要忘记背后制作人员的血汗及坚持。
本片除了在实地拍摄上延续了港产片的技术外，也吸纳了好莱坞的科技。结局的一场警局大爆炸，更是真功夫及特技的结晶表现。为求达到真实的夜光效果，制作组专程在全国搜索场景，后来在广东省租借一幢空置高楼，以数码技术替其翻新装修，同时亦进行了无数次实地试爆，以获取有关数据。
根据这些资料，泰国的特技公司人员专程到港，监察有关进度并在片厂内拍摄每个独立的爆炸镜头，而在全片关机后，特效专员仍继续工作长达三个月之久，务求把虚与实连接在一起，创造了令人咋舌和兴奋的视觉效果。另值得一提的是，导演对声效的设计可谓一丝不苟，诚邀了以创造了泰国功夫片新星Tony Chaak 的《拳霸》及《冬荫功》两片的音效设计师，替本片的动作及武打场面配以了具创造想象力的声效，让观众欣赏更具声色艺之精神满足。
《男儿本色》耗资六百万制作, 以凌厉慑人的映像, 呈现男儿正义本色及勇不可挡的杀敌动力, 演员们均以真身上阵, 演绎各种不同层次的高难度动作场面。(片花展示)为了使影片惊险、刺激而不失真实感导演这次对演员要求十分严格, 开拍前还先测试他们的体能, 看他们是否符合标准。谢霆锋自拍《龙虎门》后, 对中国功夫武术产生了浓厚兴趣, 这一次能与内地武打高手吴京合作拍电影, 他当然不会错过和长辈切磋武术的机会, 霆锋笑说在拍摄时间以外, 他和吴京经常会以切磋武艺来消磨时间, 有时候还会把家中的武器带回片场比划比划。
《男儿本色》是谢霆锋和余文乐继《龙虎门》之后的再次施展身手，陈木胜表示：“这部电影有70％左右都是动作戏，我让三人做了大量的危险动作，而且大都坚持不用替身，丝毫不逊色于敢于拼命的大哥成龙。”据悉，谢霆锋更是为此买了6000万港元的高额人身保险。陈木胜也对谢霆锋寄予了厚望：“他酷爱功夫，把刀、棒、双截棍带到片场，没事就和别人较量一番。这部电影将是把他的这一特长发挥得最全面的一次，而且我很看好他将成为香港电影功夫片接班人。
此外，首次“大打出手”的龙子房祖名也给影片带来了很大的看点，但是陈木胜透露“龙子”并不喜欢功夫：“他是开始很柔弱后来打得最狠的一个角色。房祖名看起来很单薄，他本人不喜欢功夫片，不过他的反应和灵敏度绝对很到位，因为他是龙子嘛。
警匪、动作元素一直是陈木胜比较擅长表现的，《男儿本色》也延续了这一风格，但这次的警察不再是“落魄”的成龙或者郭富城，而是三个血性方刚的年轻人：谢霆锋、房祖名和余文乐。片中三个警察在追捕犯人的过程中都是带着各自的恩怨，完全忘记了本身警察的身份，最后还是在对彼此的审视中，才意识到自己的意气用事，并为此承受了巨大的代价。
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